Skip to content


Microscope :

যে যন্ত্রের সাহায্যে কোন ক্ষুদ্র বস্তুকে অনেক গুন বড় করে দেখা যায় তাকে microscope বলে।

আবিষ্কারক : ইংরেজ বিজ্ঞানী রবার্ট হুক (Robert Hooke) সর্বপ্রথম অণুবীক্ষণ যন্ত্র আবিষ্কার করেন। 

Classification of Microscope : 

প্যাথলজিকাল অণুবীক্ষণ যন্ত্র সাধারনত ৩ ধরনের হয়।যথা- 

  1. Simple-(সরল ) : 10-20 গুণ বড় দেখায়।
  2. Compound- : 100-1000 গুণ বড় দেখায়। 
  3. Electron – : 2 লক্ষ গুণ বড় দেখায়। 

Parts of Microscope : 

একটি যৌগিক অণুবীক্ষণ যন্ত্রে বিভিন্ন অংশ সমূহকে দুই ভাগে ভাগ করা হয়েছে ।যথা- 

  1. Mechanical parts 
  2. Optical parts 

A) Mechanical parts:

  1. Base (পদদেশ ) 
  2. Pillar (স্তম্ভ) 
  3. Arm (বাহু/তল ) 
  4. Body tube (দেহ নল) 
  5. Coarse adjustment screw 
  6. Fine adjustment Screw 
  7. Draw tube (টানা নল)
  8. Stage(মঞ্চ)   
  9. Slide clip
  10. Slide Screw 
  11. Stage screw 
  12. Condenser Screw

B) Optical parts :

  1. Eyepiece
  2. Objective 
  3. Condensar 
  4. Mirror 
  5. Objective lens 
  6. Diaphragm 

Microscope Objective are four (4) types :

  1. Scanner : 4x : Histo & Cytopathological Slide দেখা হয়।
  2. Low (dry) : 10x : Balancing of magnification and working distance.
  3. High (dry) :  40x : Blood cell, Urine Slide, Stool slide দেখা হয়।
  4. Oil immersion :100x : Bacteria দেখা হয়।

N.B. 100x Objective এ Cedar wood oil ব্যবহার করা হয় কারন, 100x Objective ও Cedar wood oil এর ঘনত্ত্ব একই।

  • Difference between bacteria and virus : 
Bacteria Virus 
1)Larger than virus Smaller than bacteria 
2)Can be visible light microscope Cannot be visible light microscope 
3)Multiple by binary fission Multiple by replication 
4)Contain both DNA and RNAContain either DNA or RNA 

Bacteria : 

Bacteria :

Bacteria are unicellular microorganisms which are simple in their organisation.

Structure of Bacterial Cell : 

Essential components of bacterial cell :

  1. Nucleoid (Nucleolus, Nuclear membrane, Spindle or non identical chromosomes are absence) 
  2. Cytoplasm 
  3. Cytoplasmic membrane 
  4. Cell wall

Non essential components of bacterial cell :

  1. Flagella,
  2. Fimbriae,
  3. Capsule 
  4. Spore,
  5. Plasmid,
  6. Glycocalyx (Slime Layer)

Morphological Classification of Bacteria: 

Bacteria are classified into five groups according to their basic shapes:

  1. Cocci (Round Shaped): Cocci are spherical or round shaped bacteria. Thay can exist as in pairs (diplococci), chains (streptococci), groups or clusters (staphylococci).Example : Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Neisseria meningitidis. 
  2. Bacilli (Rod-shaped): Bacilli are rod-shaped bacteria. Example : Escherichia coli, Bacillus subtilis.
  3. Spiral (spirilla): Spirilla are spiral-shaped bacteria that can be motile or non-motile. Example : Helicobacter pylori, Campylobacter jejuni
  4. Vibrios (Comma-shaped): Vibrios are comma-shaped bacteria that are motile. Example : Vibrio cholerae
  5. Spirochetes: Spirochetes are corkscrew-shaped bacteria that are motile. Example : Treponema pallidum.

Staining basis Classification of Bacteria : 

Bacteria can be classified into two groups based on their staining properties: 

  1. Gram-positive
    1. Streptococcus pyogenes
    2. Staphylococcus aureus
    3. Bacillus subtilis 

N.B : All cocci are gram positive bacteria but Neisseria gonorrhoeae is the only cocci which is gram negative.

  1. Gram-negative.
    1. Escherichia coli
    2. Salmonella typhi
    3. Pseudomonas aeruginosa
    4. Neisseria gonorrhoeae. (Only one Gram negative cocci).

Comparison of cell walls of Gram Positive and Gram Negative bacteria :

Component Gram Positive Bacteria Gram Negative bacteria 
1.PeptidoglycanThicker, may be 40 layersThinner, 1-2 layers
2.Teichoic acidPresent Absent 
3.Lipopolysaccharide (endotoxin)Absent Present 
4.Outer membrane Absent Present 
5.Periplasmic Space Absent Present 
  • Motile bacteria : E.coli, Salmonella, vibrio, proteus, pseudomonas, clostridium tetani.
  • Non motile bacteria : All cocci, Shigella, Klebsiella, C.diphtheriae, Brucella, Bacillus anthracis.
  • Capsulated bacteria : Streptococcus, Pneumoniae, Bacillus anthracis, Staphylococcus, Streptococcus pyogenes
  • Non capsulated bacteria : Neisseria, Corynebacterium, Salmonella, Shigella, Vibrio  

Bacterial Culture :

Culture Media : 

Culture Media may be defined as an artificial food for the cultivation of bacteria in the laboratory. 

Classification of culture media :

  1. On the basis of consistency :
    1. Solid media : Blood Agar media, Chocolate Agar media, Nutrient Agar media. 
    2. Semi solid media : Soft Agar media. 
    3. Liquid media :Peptone Water media, Sugar broth.
  1. On the basis of chemical composition :
    1. Simple media : Nutrient Agar, Peptone water 
    2. Special media :
      1. Enriched media : Blood Agar medium, Lowenstein Jensen  medium.
      2. Enrichment media : Tryptic soy broth
      3. Selective media : Macconkey agar media.
      4. Indicator media : Blood Agar 
      5. Transport media : Cary-Blair media, Stuart medium
      6. Storage media : Egg Saline medium. 
  1. On the basis of O2 requirement :
    1. Aerobic media,
    2. Anaerobic media. 
  • Macconkey’s agar media  কে একই সাথে Selective ও  Indicator media বলা হয় । কারন :  

Macconkey’s Agar media contains bile salt. Bile salt inhibits the growth of non -intestinal organisms. তাই একে  Selective media বলা হয়।


Mac-Conkeys Agar media contains neutral red and lactose. Neutral red and lactose differentiate the lactose fermenters and non -lactose  fermenters bacteria. Lactose fermenter bacteria produce pink colour Colony and non-lactose fermenter produce pale colour Colony. তাই একে indicator media বলা হয়।

  • Lactose fermenters bacteria : 

Escherichia, Klebsiella, Enterobacter, Arizona, Citrobacter

  • Non- lactose fermenters bacteria : 

Salmonella, shigella, proteus,

Some organism and their suitable Media and causative disease : 

Organism Media Disease Diagnosed 
E.coli, Salmonella, Shigella,Macconkey agarDiarrhoea, Dysentery, and other diseases. 
C.diphtheriaeLoeffler SerumDiphtheria 
Bordetella pertussisBorder GanganagarPertussis
N.gonorrhoea or N.meningitidisModified Thayermartin agarGonorrhoea, Meningitis
Vibrio CholeraeMonsur’s mediaCholera 
Mycobacterium tuberculosis Lowenstein-Jensen mediumTuberculosis (TB)

Culture media that should be used for a particular pathological sample and the suspected organism:

Pathological SampleSuspected OrganismCulture Media
BloodStaphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Escherichia coliBlood agar, chocolate agar
SputumMycobacterium tuberculosis, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniaeLöwenstein-Jensen medium, Blood Agar, chocolate agar.
UrineEscherichia coli, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosaMc Conckey Agar, Nutrient Agar, 
Cerebrospinal fluidNeisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzaeBlood Agar, Chocolate Agar.
StoolSalmonella, Vibrio, ShigellaSS agar, Mc Conckey Agar, Monsur’s media.

Identification of Bacteria : 

Staining : 

Types of Stain:

  1. Gram Staining:(Gram positive /Gram Negative bacteria চিহ্নিত করার জন্য করা হয়) 
  2. Ziehl-Neelsen Staining (Tubercle bacilli (Mycobacterium tuberculosi)  চিহ্নিত (প্রদর্শন) করার জন্য করা হয়। 
  3. Albert Staining :(Corynebacterium diphtheriae চিহ্নিত করার জন্য করা হয়) 
  4. Capsule stain
  5. Spore stain
  6. Flagella stain
  7. Feulgen stain

Gram’s staining method :  

Apparatus(যন্ত্রপাতি) :

  1. Glass slide
  2. Cotton 
  3. Platinum loop /Wire loop
  4. Spirit lamp 
  5. Staining rack 
  6. Microscope 
  7. Match

Chemical reagent (রাসায়নিক দ্রব্যাদি) :  

  1. 0.5% Crystal violet or gentian violet or methylene violet
  2. Lugol’s Iodine
  3. Alcohol/Acetone
  4. Distilled water 
  5. 01 in 10 diluted carbol fuchsin
  6. Cedar Wood Oil
  7. Normal saline 

Specimen : Bacterial culture colony, Pus, Body fluid, Sputum.

Step of Gram’s staining method (কাজের ধারা) :

  1. Preparation and fixation of the film (ছবি তৈরি ও স্থায়ীকরণ) 
  2. Staining (রং করন) : এখন ছবিটিকে রং করিবার জন্য  স্লাইড টিকে  staining rack এর  উপর স্থাপন করি এবং 0.5% Crystal violet দ্রবণ কয়েক ফোঁটা (Drops) ছবির উপর ঢালিয়া দিয়া ০১ মিনিট অপেক্ষা করি। 
  3. Mordanting (রং বৃদ্ধি করন) : ছবির রং বৃদ্ধি করিবার জন্য স্লাইড এর উপর কয়েক ফোটা Lugol’s Iodine দিয়ে ধুয়ে ফেলি এবং পুনরায় কয়েক ফোটা Lugol’s Iodine দিয়া ০২ মিনিট অপেক্ষা করি। 
  4. Decolourization (রং উঠানো  ) : রং উঠাইবার জন্য একবার alcohol, একবার distilled water এভাবে পর্যায়ক্রমে দিতে থাকি যতক্ষণ না slide – এর অতিরিক্ত রং উঠে যায়। তবে হালকা বেগুনি রং থাকবে। 
  5. Counter stain (পুনরায় রং করন) : ছবিটির পুনরায় রং করিবার জন্য কয়েক ফোটা 1 in 10 diluted Carbol fuchsin  ঢালিয়া দিয়া  30 (Thirty) সেকেন্ড অপেক্ষা করি। 
  6. wash and dry (ধৌতকরণ এবং শুষ্ক করন) :স্লাইড এর  উভয় পার্শ্ব ট্যাপের পানি দ্বারা ধৌত করি এবং বাতাসে শুকায়। এখন স্লাইডের যে পাশে ছবি আছে সেই ছবির উপর ১ ফোটা Cedar Wood oil নামক বিশেষ তৈল দিয়া অণুবীক্ষণ যন্ত্রের Oil immersion লেন্সে দেখি। 
  7. Result ( ফলাফল) : 
  • যদি জীবানু গুলিকে বেগুনি রংয়ের দেখি তবে জীবাণুগুলি Gram positive
  • যদি জীবাণু  গুলি লাল রঙের দেখি তবে জীবাণুগুলি Gram Negative.

(অবশ্যই কিছু Gram positive ও Gram Negative bacteria এর উদাহরন জানতে হবে। অনুগ্রহপূর্বক Classification of Bacteria দেখুন)।


Principle (মূলতত্ত্ব) : 

যে প্রক্রিয়ার সাহায্যে Acid Fast Bacillus কে সনাক্ত করা হয় তাকে  Acid Fast Stain বলে । যে সকল Organism কে রং করার পর বারবার Acid দ্বারা ধৌত করলেও রং দূর হয় না তাদের Acid Fast Bacillus বলে। 

Acid Fast Stain করার জন্য নিম্ন বর্ণিত যন্ত্রপাতি ও রাসায়নিক দ্রব্যাদি প্রয়োজন :

Apparatus(যন্ত্রপাতি) :

  1. Glass slide
  2. Cotton 
  3. Platinum loop /Wire loop
  4. Spirit lamp 
  5. Staining rack 
  6. Microscope 
  7. Match
  8. Test tube with holder 

Chemical Reagent ( রাসায়নিক দ্রব্যাদি): 

  1. Carbol Fuchsin
  2. 20% H2So4/3%Hcl
  3. Methylene blue/Malachite green
  4. Distilled water 
  5. Cedar Wood Oil

Specimen : Mainly Sputum, CSF, Body fluid,

Steps of Acid Fast Bacillus Staining method (কাজের ধারা) :

  1. Preparation and fixation of the film (ছবি তৈরি ও স্থায়ীকরণ). 
  2. Staining(রং করন) : এখন ছবিটিকে রং করিবার জন্য স্লাইড টিকে staining rack এর উপর রাখি। একটি টেস্ট টিউবে পরিমাণ মতো Carbol fuchsin solution নিয়ে স্পিরিট ল্যাম্পের শিখায় ধরি যতক্ষণ না উহা ধুমায়িত হয়। উক্ত ধুমায়িত সলুশন স্লাইড এর উপর ঢালিয়া দিয়া ০৫-১০ মিনিট অপেক্ষা করি। 
  3. Decolourisation (রং উঠানো) : ছবিটির অতিরিক্ত রং উঠাইবার জন্য পর্যায়ক্রমে একবার ২০% H2SO4 এবং একবার Distilled water দ্বারা ধৌত করি যতক্ষণ না উহার অতিরিক্ত রং উঠে, তবে হালকা গোলাপি রঙ থাকিবে। 
  4. Counter Stain(পুনরায় রং করেন) : ছবিটির পুনরায় রং করিবার জন্য Methylene blue ঢালিয়া দিয়া ০১ মিনিট অপেক্ষা করি। (Malachite green হলে ০২ মিনিট অপেক্ষা করি)। 
  5. Wash and dry (ধৌতকরণ এবং শুষ্ক করন) : স্লাইডের  উভয়  পার্শ্ব   ট্যাপের পানি দ্বারা ধৌত করি এবং বাতাসে শুকায়। এখন স্লাইডের যে পাশে ছবি আছে সেই ছবির উপর এক ফোটা Cedar wood oil দিয়ে মাইক্রোস্কোপের Oil immersion লেন্সে দেখি। 
  6. Result(ফলাফল) : যদি অণুবীক্ষণ যন্ত্রের নিচে লাল রংয়ের দন্ডাকৃতি ব্যাকটেরিয়া দেখি তবে A.F.B (+ve)

N.B. : Mycobacterium tuberculosis is acid-fast {A.F.B (+ve)}. Not Gram-positive or Gram Negative. Mycobacterium tuberculosis has a waxy cell wall that makes it difficult to stain with the Gram stain method.

(Mycobacterium tuberculosis কে Gram staining method এ Stain করা যায় না।)

Mycobacterium Leprae : Leprosy রোগের জন্য দায়ী। Specimen : Ear lobe (Skin tissue is taken from an affected area).
N.B. : Staining এর সময় Decolourisation (রং উঠানো) এর জন্য 5% H2SO4 ব্যবহার করতে হবে।
Name of Stain : Modified AFB Staining.

Catalase Test : 

The test Which facilitates detection of enzyme catalase in bacteria is called catalase test.

Catalase Positive Bacteria :

  1. Staphylococcus
  2. Corynebacterium diphtheriae
  3. Salmonella
  4. Mycobacterium tuberculosis
  5. Escherichia Coli(E.coli)

Catalase Test করা হয় মূলত Streptococcus ও Staphylococcus কে আলাদা করার জন্য।Streptococcus Catalase Negative এবং Staphylococcus Catalase Positive.

Coagulase Test : 

The coagulase test is used to identify bacteria that produce the enzyme coagulase.

Coagulase Positive Bacteria : Staphylococcus aureus.

Other Staphylococcus species are Coagulase Negative. e.g.  Staphylococcus epidermidis.  

Some Biochemical Tests used to identify Bacteria : 

  1. Oxidase test.
  2. Kligler’s Iron Agar (KIA) test.
  3. Triple Sugar Iron Agar test.
  4. MIU (Motility Indole Urease) Agar Test.
  5. Simmons Citrate Agar
  • Toxin :

These are chemical substances produced by bacterial metabolism that are inhibitory or lethal to the cells of the host. It may be exotoxin or endotoxin.

  • Toxoid:

This is a modified toxin.  Antigenicity of toxins is called toxoid, where the toxicity of toxins is destroyed.


Virus : 

Viruses are particles composed of an internal core containing either DNA or RNA covered by a protective protein coat.

Classification of Virus : 

Mainly Two types based on their presence of Nucleic acid.

  1. DNA Virus
  2. RNA Virus 

Name of some DNA Virus with their disease : 

DNA virus Disease
Pox virus Smallpox 
Herpes virus Conjunctivitis 
Papova virus Papilloma 
Adenovirus Acute respiratory disease 
Human papillomavirus Warts
Hepatitis B virus Jaundice 

Name of some RNA virus with their disease : 

RNA virus Disease 
Dengue virus Dengue fever 
Rubella virus Rubella 
Polio virus Poliomyelitis 
Measles virus Measles 
Mumps virus Mumps

Culture of virus : 

  1. Embryonated egg culture.
  2. Tissue culture.

Parasitology :

চিকিৎসা বিজ্ঞানের যে শাখায় Parasite সম্পর্কে আলোচনা করা হয় তাকে Parasitology বলে।

Some common parasites : 

ClassName Disease

Entamoeba HistolyticaAmoebic dysentery
Leishmania donovaniKala Azar
Plasmodium speciesMalaria
Giardia lambliaDiarrhoea 
Trichomonas VaginalisLeukoria 

Ascaris Lumbricoides (AL)Ascariasis
Ancylostoma duodenale (AD)Ancylostomiasis
Taenia Solium(Pork tapeworm)Taeniasis
Taenia saginata(Beef Tapeworm)Taeniasis
Trichuris trichiura (TT)Trichuriasis

Blood borne parasite :

The blood borne parasites which can be found in the bloodstream of an infected person are called blood borne parasites. 

Common blood parasite, Vector and disease : 

Parasite ClassVector Disease 
Leishmania donovani,  (found in blood monocytes). ProtozoaSand fly Kala-azar
Plasmodium species- found in RBC (Plasmodium vivax, Plasmodium falciparum, Plasmodium ovale)ProtozoaFemale Anopheles Mosquito Malaria 
Microfilariae(Wuchereria bancrofti) found in plasma MetazoaFemale culex mosquito Filariasis 

Fungus : 

Fungus are Chlorophyll free, non photosynthetic eukaryotic (Multicellular microorganism.)

Morphological Classification of fungi : 

YeastsCryptococcus neoformans
Yeasts like fungiCandida albicans
Dimorphic fungiBlastomyces dermatitidis

Sterilisation : 

Sterilisation : 

Sterilisation is the process by which all viable microorganisms including spores are killed or eliminated. 

Classification of sterilisation : 

  1. Physical 
  2. Chemical 
  3. Filtration 

A.Physical method : 

  1. Heat
    • High Heat
      • Dry Heat
        • Hot air oven 
        • Incineration
      • Moist Heat
        • Boiling
        • Steaming
          • With Pressure
            • Autoclave
          • Without Pressure
            • Tyndallization
            • Koch’s Steamer
        • Pasteurization
          • Holding Method
          • Flash Method
    • Low Heat
      • Water Bath
      • Vaccine Bath
  2. Radiation
    • X-ray
    • Gamma ray
    • UV ray

B.Chemical method : 

  1. Alcohols.
  2. Phenols.
  3. Ethylene oxide.

C.Filtration : 

  1. Bark Field
  2. Chamber land

Autoclave : 

Principle :121°C তাপমাত্রায় 15 lb/Square inch চাপে ১৫ মিনিট রাখিয়া Spore সহ সকল জীবাণু ধ্বংস করা হয়। 

Autoclave এর সাহায্যে নিম্নলিখিত যন্ত্রপাতি ও সামগ্রী জীবাণুমুক্ত করা হয় : 

  1. Culture media 
  2. অস্ত্র পাচারের ভোঁতা যন্ত্রপাতি

N.B. : ধারালো যন্ত্রপাতি গুলোকে Lysol, Dettol  এর মধ্য ৩০ মিনিট কাল ডুবাইয়া রাখিয়া জীবাণুমুক্ত করা হয়। Autoclave -দিয়ে যদি ধারালো যন্ত্রপাতি জীবাণুমুক্ত করা হয় ,তাহলে ধারালো যন্ত্রপাতি ভোঁতা হয়ে যাবে। এইজন্য ধারালো যন্ত্রপাতি Lysol, Dettol দিয়ে  জীবাণুমুক্ত করা হয়।

  1. কাঁচের  যন্ত্রপাতি 
  2. অপারেশন থিয়েটারে ব্যবহৃত হাতের দাস্তানা, Gauge.
  3. অপারেশন থিয়েটারে ব্যবহৃত বিভিন্ন কাপড়-চোপড় যেমন- Apron, Face mask ইত্যাদি।
  4. শক্ত রাবারের জিনিসপত্র। যেমন-ক্যাথেমিটার, রাইলস টিউব ইত্যাদি।


Principle : এই যন্ত্রের সাহায্যে 160°c তাপমাত্রায় এক ঘন্টা কাল রাখিয়া Spore সহ সকল জীবানু ধ্বংস করা হয়। 

Hot Air Oven এর সাহায্যে নিম্নলিখিত যন্ত্রপাতি জীবাণুমুক্ত  করা যায়।যথা-

  1. Glassware – all glass syringe, petridish, test tube, slide. 
  2. Swab sticks
  3. High boiling fluid, oil 
  4. Powder 

Tyndallization :

This is a sterilisation procedure by intermittent heating at 100°c.

Use of Tyndallization: Sterilisation of culture media, containing egg,  serum, sugar and gelatin.

Centrifuge  Machine :

প্রকারভেদ :

  • চালিকা শক্তি অনুযায়ী : ১) Hand-Operated Centrifuge

                                 ২) Electric Centrifuge 

                                 ৩) Battery-Operated Centrifuge 

  • আকার অনুযায়ী : ১) Table Top Model বা Bench Centrifuge 

                                    ২) Floor Model

  • Rotor অনুযায়ী :  ১) Fixed Angel Rotor

                          ২) Swing Out Rotor

                          ৩) Haematocrit Rotor

Suspension            = যখন particles গুলো অদ্রবণীয় অবস্থায় থাকে।  Rotor                      = Centrifuge  এর head এর সাথে সংযুক্ত ঘূর্ণায়মান অংশ যাতে bucket লাগানো হয়।Supernatant fluid    = The liquid above a precipitate or a sediment. RPM                       =Revolutions Per Minute.  RCF                        = Relative Centrifugal Force.
  • Covid -19 : Corona Virus Disease -2019.

COVID-19 is a respiratory illness caused by a virus called Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2). The virus was first identified in Wuhan, China, in December 2019, and has since spread to over 200 countries and territories, causing a global pandemic.

WHO (World Health Organisation) declared Covid 19 as a Pandemic on 11 march 2020.

Criteria of the COVID-19 Virus : 

Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2).

  • CoronaVirus
  • RNA virus.
  • Single Stranded, Negative sense. 
  • Member of the Beta Coronavirus group of viruses.
  • SARS-CoV-2 is a new coronavirus that had not been seen before in humans.
Beta Coronaviruses are known to cause respiratory illness in humans, animals, and birds.

Types of Covid-19 disease: 

There are two main types of COVID-19 disease: 

  1. Mild : Fever, cough, shortness of breath, and fatigue.
  2. Severe :  Pneumonia, acute respiratory distress syndrome, multi-organ failure, death.

Diagnosis of Covid 19 : 

COVID-19 can be diagnosed through a variety of tests, including:

  • Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) test. 
  • Antibody test. 
  • Serology test.
error: Content is protected !!